En tant que plus haute juridiction de l'Etat, la Cour Suprême est l'institution de contrôle et de sanction de l'exercice du pouvoir d'Etat et ses décisions ne sont susceptibles d'aucun recours.

Elle est compétente en matière administrative en exerçant le contrôle du pouvoir exécutif par l'annulation des actes réglementaires irréguliers.

Elle est compétente en matière judiciaire en exerçant le contrôle du pouvoir judiciaire par la cassation.

Elle est compétente en matière des comptes de l'Etat en exerçant le contrôle de tous les pouvoirs publics par la vérification de leurs comptes.

Elle est aussi spécifiquement compétente en ce qui concerne le contentieux des élections locales.

La Cour Suprême se trouve ainsi au coeur du contrôle juridictionnel des pouvoirs publics et de toutes les institutions de Etat, contrôle sans lequel il ne saurait y avoir de bonne gouvernance.

En dehors de ses attributions juridictionnelles, la Cour Suprême peut être consultée par le Gouvernement sur toutes les matières administratives et juridictionnelles. La Cour rend des avis motivés sur tous les projets de lois, ordonnances et actes réglementaires avant leur transmission à l'Assemblée Nationale. La Cour peut également être chargée à la demande du Chef de l'Etat de la rédaction et de la modification de tous les textes législatifs et réglementaires avant leur examen par l'Assemblée Nationale.

En outre, la Cour Suprême donne des avis juridiques sur la légalité des accords que la République du Bénin signe avec d'autres pays ou organismes internationaux.